Het onderwijs op het Cygnus Gymnasium is een combinatie van klassikale lessen en activerende didactiek. Met dat laatste bedoelen we dat leerlingen waar mogelijk, en in toenemende mate, invloed hebben op wat en hoe ze leren. Begaafde leerlingen willen dikwijls graag zelf aan de slag in plaats van langdurig afwachtend te luisteren. Dit zelf willen en kunnen leren krijgt op het Cygnus Gymnasium voorrang; we beschouwen het als de belangrijkste motor voor een plezierige en succesvolle schoolcarrière.

De schooldag bestaat uit klassikale en groepsactiviteiten waarin daarnaast tijd is om zelfstandig te werken en leren. Bij dat laatste geven docenten je steeds de nodige hulp en begeleiding. Je krijgt les volgens de stelregel: klassikaal als dat nodig of leuk is, zelfstandig als het kan.

Bij 'zelfstandig' moet je ook denken aan werken in tweetallen of kleine groepen. Leren samenwerken is erg belangrijk: in veel beroepen en in de wetenschap komen mensen juist in samenwerking tot de grootste prestaties. De afwisseling tussen klas, groep en je eigen werkplek stimuleert bovendien je concentratie.

De begeleiding tijdens het zelf- werken wordt verzorgd door vakdocenten. Daarnaast heb je een mentor, ook een vakdocent, die jouw raadgever is over het schoolwerk en alle andere schoolse zaken. Ten slotte werken we met een systeem van leerlingtutoren, waarbij leerlingen uit de bovenbouw begeleiding bieden aan kleine groepjes onderbouwleerlingen.